Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFI35P80217 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFI35P80217 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI35P80217 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFI35P80217 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms