Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD12P35452 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms