Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX4I1P13073 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms