Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHF1O43189 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHF1O43189 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHF1O43189 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHF1O43189 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHF1O43189 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHF1O43189 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHF1O43189 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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