Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E9PBE3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E9PBE3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms