Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms