Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4CQ9C0C4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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