Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SALL3Q9BXA9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms