Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms