Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms