Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

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Length 1,156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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CD163Q86VB7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CD163Q86VB7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CD163Q86VB7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD163Q86VB7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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