Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NTRK3Q16288 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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