Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms