Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NCOA4Q13772 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NCOA4Q13772 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NCOA4Q13772 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCOA4Q13772 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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