Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 512.82□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNX1-212ENST00000560861 850 ntTSL 312.79□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 YIPF5-202ENST00000448443 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 C2CD2L-202ENST00000525598 5931 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-218ENST00000489337 3560 ntTSL 212.73□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-205ENST00000474588 1789 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.385e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RRP8-205ENST00000534343 726 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RNF215-202ENST00000332468 8141 ntTSL 512.41□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 YIPF5-204ENST00000513112 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 WSB2-210ENST00000543218 935 ntTSL 212.23□□□□□ -0.455e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-206ENST00000479719 2340 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-214ENST00000554892 658 ntTSL 212.19□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-213ENST00000480467 931 ntTSL 312.15□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CAPZA2-201ENST00000361183 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 THUMPD1-202ENST00000396083 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-10■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-213ENST00000606184 2966 nt11.81□□□□□ -0.526e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 511.57□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.595e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDF2-203ENST00000585749 823 ntTSL 311.31□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.626e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-212ENST00000554554 2955 ntTSL 211.04□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-217ENST00000477394 816 ntTSL 510.96□□□□□ -0.655e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-202ENST00000460034 2081 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.695e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDF2-207ENST00000588472 681 ntTSL 210.63□□□□□ -0.715e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-205ENST00000425647 2747 ntTSL 210.34□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-210ENST00000474262 549 ntTSL 210.3□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AAED1-203ENST00000446045 2723 ntTSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-232ENST00000557391 459 ntTSL 210.14□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.796e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.86e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-208ENST00000495751 558 ntTSL 310□□□□□ -0.815e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-204ENST00000467167 2242 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 59.61□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.945e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-211ENST00000465412 710 ntTSL 59.11□□□□□ -0.955e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDF2-210ENST00000592250 1025 ntTSL 28.94□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AAED1-202ENST00000411939 2514 ntTSL 38.88□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.025e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.035e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.055e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MRPS28-205ENST00000519386 555 ntTSL 28.24□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TMEM218-211ENST00000531262 857 ntTSL 28.09□□□□□ -1.115e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDF2-205ENST00000587629 775 ntTSL 37.86□□□□□ -1.155e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 37.81□□□□□ -1.165e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 37.81□□□□□ -1.165e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-10■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.215e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RPF2-204ENST00000607388 3621 ntTSL 1 (best)7.17□□□□□ -1.265e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.35e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CAPNS1-208ENST00000589162 701 ntTSL 36.9□□□□□ -1.36e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.355e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-212ENST00000469553 2103 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.395e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDF2-206ENST00000587788 444 ntTSL 36.36□□□□□ -1.395e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RHNO1-210ENST00000623153 1008 nt6.14□□□□□ -1.435e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-216ENST00000476444 679 ntTSL 26.07□□□□□ -1.445e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RBM18-203ENST00000491850 614 ntTSL 35.92□□□□□ -1.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 STXBP5-206ENST00000443556 1477 ntTSL 1 (best)5.69□□□□□ -1.55e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 STT3B-206ENST00000463044 912 ntTSL 35.63□□□□□ -1.515e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-207ENST00000463295 607 ntTSL 55.53□□□□□ -1.525e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-215ENST00000475056 682 ntTSL 35.33□□□□□ -1.565e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CD164-205ENST00000415861 4963 ntTSL 1 (best)5.23□□□□□ -1.576e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.585e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DTWD1-204ENST00000557988 1201 ntTSL 1 (best)5.04□□□□□ -1.65e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-220ENST00000490249 710 ntTSL 34.83□□□□□ -1.645e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.685e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MIER2-205ENST00000619835 1748 ntTSL 319.77■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NDUFB3-201ENST00000237889 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.455e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.995e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.095e-11■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.028e-9■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 ARPC4-202ENST00000417500 957 ntTSL 523.74■■□□□ 1.398e-9■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 ARPC4-204ENST00000440787 910 ntTSL 323.57■■□□□ 1.368e-9■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 NAA10-216ENST00000488481 569 ntTSL 221.82■■□□□ 1.084e-8■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.873e-13■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.323e-13■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.932e-6■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 RPL13A-207ENST00000476300 619 ntTSL 311.63□□□□□ -0.551e-22■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.18e-7■□□□□ 10.7
PABPC4Q13310 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 213.54□□□□□ -0.248e-7■□□□□ 10.7
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