Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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