Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms