Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDI1P31150 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDI1P31150 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDI1P31150 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDI1P31150 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDI1P31150 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDI1P31150 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms