Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALDH4A1P30038 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms