Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCL3L1P16619 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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