Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TJP3O95049 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TJP3O95049 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TJP3O95049 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms