Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms