Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms