Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGSM2O43147 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms