Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF26H0Y7S4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms