Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms