Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLA2G4CQ9UP65 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms