Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EHD2Q9NZN4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD2Q9NZN4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms