Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHACTR1Q9C0D0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms