Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIC2Q96JB3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms