Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP4R4Q6NUP7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms