Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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