Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BFSP2Q13515 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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