Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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