Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FOXD4Q12950 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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