Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TFAMQ00059 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms