Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACADLP28330 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADLP28330 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADLP28330 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADLP28330 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADLP28330 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADLP28330 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 987.6 ms