Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms