Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms