Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GABARAPL3Q9BY60 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms