Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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