Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms