Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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