Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GBX1Q14549 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GBX1Q14549 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GBX1Q14549 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GBX1Q14549 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GBX1Q14549 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GBX1Q14549 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX1Q14549 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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