Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKAA1Q13131 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms