Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCDC1P59894 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms