Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms