Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF9P41273 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms