Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5CP41229 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms