Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms